11.9.17

Clasificando los fémures de saurópodos con "machine learning" en el XV Annual Meeting de la EAVP


Con un nombre a priori rimbombante para el no iniciado, se presentó una ración de algoritmos para clasificar saurópodos en formato póster en el XV Annual Meeting de la EAVP en Múnich. Aunque su nombre sugiera la implementación de técnicas complejas, el empleo de diferentes tipos de algoritmos como parte de los análisis discrimiantes son el día a día en muchos campos de la paleontología. Acostumbrados al Análisis Discriminante Lineal (LDA) o las Variantes Canónicas entre los múltiples nombres con los que se les conocen, son herramientas que nos permiten como su nombre indica, discriminar entre grupos.

Dada una base de datos de variables numéricas como pueden ser medidas, o coordenadas de landmarks fijados en un resto fósil, podemos tratar de discriminar los elementos que pertenecen a una u otra especie. No obstante, parece que en saurópodos la variabilidad intraespecífica juega en contra y no es tan sencillo entre los géneros de saurópodos más derivados de titanosaurios. Dicho esto, tampoco hay que desesperar, tan solo cambiando el algoritmo, adaptamos la mejor herramienta para resolver nuestro problema. En este caso particular se comparan un método tradicional como el LDA que se basa en la media de cada género (que conforma un núcleo de medidas) frente a Support Vector Machine, un algoritmo que discrimina de forma distinta, por medio de las fronteras entre esos grupos predefinidos. Este último se propone como una herramienta ligeramente mejor en casos como los fémures de titanosaurio, que parecen tener una frontera difusa, compleja, entre los distintos géneros conocidos.

El resumen es el siguiente:

Titanosaur sauropods were a highly diverse group of dinosaurs in the Ibero-Armorican Upper Cretaceous. The proposed sauropod diversity equals or surpasses those proposed for the high diversity in the Upper Jurassic of the Iberian Peninsula. However, some of the information of the Ibero-Armorican titanosaurs come from isolated elements.
The scarcity of characters as well as the absence of relationship between parts of the skeleton renders the exploration of this diversity rather difcult. Assessing the overall number of different taxa or morphotypes is important to achieve conclusion on aspects such as its paleoecology. Discriminant analyses have been used as a helpful tool with other isolated and sometimes abundant dinosaur remains such as theropod teeth. In this sense, there is a huge available sample of appendicular elements of Ibero-Armorican titanosaurs, and particularly femora. However, as some studies imply, morphometric data of derived sauropod appendicular elements do not satisfy normality criteria. Indeed, albeit having a conservative bauplan, preliminary comparisons show high variability that complicates the application of some statistics such as the traditional discriminant analyses.
Here some analyses covering Linear Discriminant Analyses (LDA) and Canonical Variate Analyses (CVA) are presented in order to help assign the isolated femora to corresponding titanosaur genera. Also, as sauropod fossil records yield uneven groups, the resulting sample has a heterogeneous N. It is proposed the use of Support Vector Machines as an alternative unbiased method for classifcation

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Más información:
  • Páramo, A., F. Ortega, and J. L. Sanz. 2017. Comparison Between Classification Methods for Isolated Appendicular Titanosaur Bones. 15th Annual Meeting of the European Association of Vertebrate Palaeontologists, 30.

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